view in publisher's site

Novel in silico analyses of repetitive spider silk sequences to understand the evolution and mechanical properties of fibrous protein materials

Abstract The mechanical properties of spider silks have diverged as spiders have diversely speciated. Because the main components of silks are proteins, it is valuable to investigate their sequences. However, silk sequences have been regarded as difficult information to analyze due to their imbalance and ITR. Here, we applied an in silico approach to systemically analyze a group of silk sequences. We found that every time new spider groups emerged, unique trimer motifs appeared. These trimer motifs were used to find additional clues of evolution and to determine relationships with mechanical properties. We, for the first time, provided crucial evidence that silk sequences are coevolved with spider species and the mechanical properties of their fibers to adapt to new living environments. This novel approach can be used as a platform for analyzing other groups of ITR‐harboring proteins and to give information for the design of tailor‐made fibrous protein materials. This article is protected by copyright. All rights reserved.

تحلیل silico توالی‌های تکراری ابریشمی تار عنکبوتی برای درک تکامل و خواص مکانیکی مواد پروتیینی فیبری

چکیده ویژگی‌های مکانیکی و مکانیکی ابریشم به عنوان عنکبوت از هم جدا شده‌اند. از آنجا که اجزای اصلی ابریشم، پروتیین‌ها هستند، بررسی توالی آن‌ها ارزشمند است. با این حال، توالی ابریشم به عنوان اطلاعات دشوار برای تجزیه و تحلیل به خاطر عدم تعادل و عدم تعادل در نظر گرفته شده‌است. در اینجا ما روش in را برای تحلیل سیستمی یک گروه از دنباله‌های ابریشمی بکار بردیم. ما دریافتیم که هر بار که گروه‌های عنکبوتی جدید ظاهر می‌شوند، موتیف های بی‌نظیر trimer ظاهر می‌شوند. این نقش trimer برای یافتن نشانه‌های اضافی از تکامل و تعیین روابط با ویژگی‌های مکانیکی مورد استفاده قرار گرفت. ما برای اولین بار شواهد بسیار مهمی را ارایه کردیم که دنباله‌های ابریشمی با گونه‌های عنکبوت و ویژگی‌های مکانیکی of سازگار هستند تا با محیط‌های زنده جدید انطباق پیدا کنند. این روش جدید می‌تواند به عنوان یک بس‌تر برای تجزیه و تحلیل گروه‌های دیگر از پروتئین‌های itr - harboring مورد استفاده قرار گیرد و اطلاعات مربوط به طراحی مواد پروتیینی ایجاد شده توسط خیاط را ارایه دهد. این مقاله توسط کپی‌رایت مورد حمایت قرار می‌گیرد. تمام حقوق محفوظ است.

ترجمه شده با

Download PDF سفارش ترجمه این مقاله این مقاله را خودتان با کمک ترجمه کنید
سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

95/12/18 - با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس و کروم٬ چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.