Computational methods in noncoding RNA research

Non protein-coding RNAs (ncRNAs) are a research hotspot in bioinformatics. Recent discoveries have revealed new ncRNA families performing a variety of roles, from gene expression regulation to catalytic activities. It is also believed that other families are still to be unveiled. Computational methods developed for protein coding genes often fail when searching for ncRNAs. Noncoding RNAs functionality is often heavily dependent on their secondary structure, which makes gene discovery very different from protein coding RNA genes. This motivated the development of specific methods for ncRNA research. This article reviews the main approaches used to identify ncRNAs and predict secondary structure.

روش‌های محاسباتی در تحقیق RNA noncoding

Non protein (ncRNAs)نقطه کانونی تحقیقات در بیوانفورماتیک هستند. اکتشافات اخیر نشان می‌دهد که خانواده‌های ncRNA جدید نقش‌های متنوعی را از تنظیم بیان ژن به فعالیت‌های کاتالیزوری انجام می‌دهند. همچنین بر این باور است که دیگر خانواده‌ها هنوز باید پرده‌برداری شوند. روش‌های محاسباتی که برای ژن‌های کدکننده پروتئین ایجاد می‌شوند اغلب هنگام جستجوی for شکست می‌خورند. noncoding RNAs معمولا به شدت به ساختار ثانویه شان وابسته است، که این امر کشف ژن را بسیار متفاوت از ژن‌های RNA کدگذاری پروتیینی می‌کند. این امر توسعه روش‌های خاص برای تحقیق ncRNA را برانگیخته است. این مقاله رویکردهای اصلی مورد استفاده برای شناسایی ncRNAs و پیش‌بینی ساختار ثانویه را بررسی می‌کند.

ترجمه شده با