view in publisher's site

Experimental Analysis of Global Gene Regulation in Escherichia coli

Publisher SummaryThis chapter focuses on experimental approaches to study global regulation in Escherichia coli (E. coli). The advantages and disadvantages of using global regulators can be illustrated by using an economic analogy. Bacteria, which often live in highly competitive environments and are not protected by the homeostases provided to the cells of multicellular organisms, cannot afford to have a welter of uncoordinated responses to a change in temperature or nutrient availability. One of the first questions encountered in studying global regulation involves the breadth of the particular regulon—that is, the number of genes that are regulated. Various methods are available, both in vitro and in vivo, to help answer this question. Each method has its own strengths and weaknesses, but a combination of several methods often serves to gain a good understanding of a regulon's size and sometimes even a hint of the class to which the relevant regulator belongs. There are now numerous methods for determining which genes and proteins belong to a given regulon. The signal transduction pathway in the nitrogen regulon has been elicited in detail by in vitro studies with purified components, and the interaction of the transcriptional activator—NRI—with at least one target gene—glnA—is understood at the molecular level.

آنالیز تجربی مقررات جهانی ژن در اشرشیاکلی

این فصل بر روی رویکردهای تجربی برای مطالعه مقررات جهانی در Escherae coli (E. coli بود. مزایا و معایب استفاده از تنظیم‌کننده‌های جهانی را می توان با استفاده از قیاس اقتصادی نشان داد. باکتری‌ها، که اغلب در محیط‌های بسیار رقابتی زندگی می‌کنند و توسط سلول‌های موجود در ارگانیسم‌های چند سلولی محافظت نمی‌شوند، نمی‌توانند جوانه‌ای از پاسخ‌های غیر هماهنگ به تغییر در دما یا دسترسی به مواد مغذی داشته باشند. یکی از اولین پرسش‌هایی که در مطالعه مقررات جهانی با آن مواجه می‌شویم، گستره یک قاعده خاص است - یعنی، تعداد ژن‌هایی که تنظیم می‌شوند. روش‌های مختلفی هم در شرایط آزمایشگاهی و هم در شرایط زنده برای کمک به پاسخ به این سوال وجود دارد. هر روش نقاط قوت و ضعف خاص خود را دارد، اما ترکیبی از چندین روش اغلب برای به دست آوردن درک خوبی از اندازه یک تنظیم‌کننده و گاهی اوقات حتی یک اشاره از کلاسی که تنظیم‌کننده مربوطه به آن تعلق دارد، بکار می‌رود. در حال حاضر روش‌های متعددی برای تعیین این که کدام ژن‌ها و پروتئین‌ها متعلق به یک قانون مشخص هستند، وجود دارد. مسیر انتقال سیگنال در تنظیم نیتروژن با مطالعات آزمایشگاهی با اجزای خالص به طور مفصل استخراج شده‌است و تعامل فعال‌کننده رونویسی - NRI - با حداقل یک ژن هدف - glnA - در سطح مولکولی درک شده‌است.
ترجمه شده با

سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.