view in publisher's site

Solution conformation of methylated macrolide antibiotics roxithromycin and erythromycin using NMR and molecular modelling. Ribosome-bound conformation determined by TRNOE and formation of cytochrome P450-metabolite complex

Conformational study of methylated derivatives of macrolide antibiotics roxithromycin (6-OMe-roxithromycin and 6,11-OMe-roxithromycin) has been achieved by NMR in solution and molecular dynamics (MD) simulations and compared to 6-OMe-erythromycin (clarithromycin). A complete conformational study by NMR has been led by determination of homonuclear coupling constants and NOEs. Heteronuclear 1H-13C coupling constants were also measured to investigate the orientation of the sugar moieties with respect to the erythronolide. MD simulations were performed using the crystallographic coordinates as the starting conformation. For each compound, experimental results were compared to calculated conformations in order to identify eventual conformational equilibrium in solution. It is shown that the effect of the methylation is opposite for roxithromycin compared to erythromycin especially on motional properties as the roxithromycin derivatives gain in mobility while the erythromycin derivatives behaves as a more restrained molecule. The study of macrolide-ribosome interactions has been investigated using transferred NOESY 1H NMR experiments and the conformations weakly bound to bacterial ribosomes were determined. Biological interactions of these compounds with membranar liver protein cytochrome P450 was also discussed with regard to their structural properties.

ترکیب محلول آنتی‌بیوتیک‌های متیل ماکرولید روکسیترومایسین و اریترومایسین با استفاده از NMR و مدل‌سازی مولکولی. کنفورماسیون محدود به ریبوزوم تعیین‌شده توسط TRNOE و تشکیل کمپلکس سیتوکروم P۴۵۰ - متابولیت

مطالعه کنفورماسیونی مشتقات متیله آنتی‌بیوتیک‌های ماکرولیده روکسیترومایسین (۶ - OME - روکسیترومایسین و ۶، ۱۱ - OME - روکسیترومایسین)توسط NMR در شبیه‌سازی‌های محلول و دینامیک مولکولی (MD)و در مقایسه با ۶ - OME - اریترومایسین (کلاریترومایسین)به دست آمده‌است. یک مطالعه ترکیبی کامل توسط NMR با تعیین ثابت‌های جفت شدگی غیرهستهای و NOE ها انجام شده‌است. ثابت‌های جفت شدگی غیرهستهای ۱ H - ۱۳ C نیز برای بررسی جهت گیری بخش‌های قند با توجه به اریترونولید اندازه‌گیری شدند. شبیه‌سازی MD با استفاده از مختصات کریستالوگرافی به عنوان کنفورماسیون اولیه انجام شد. برای هر ترکیب، نتایج تجربی با کنفورماسیون های محاسبه‌شده به منظور شناسایی نهایی تعادل کنفورماسیونی در محلول مقایسه شدند. نشان‌داده شده‌است که اثر متیلاسیون برای روکسیترومایسین در مقایسه با اریترومایسین به ویژه در خواص حرکتی برعکس است چون بهره مشتقات روکسیترومایسین در تحرک است در حالی که مشتقات اریترومایسین به عنوان یک مولکول مهار شده‌تر عمل می‌کنند. مطالعه برهمکنش‌های ماکرولیدها - ریبوزوم با استفاده از آزمایش‌های NOESY ۱ H NMR انتقال داده شد و ترکیبات با اتصال ضعیف به ریبوزوم های باکتریایی تعیین شدند. برهمکنش‌های بیولوژیکی این ترکیبات با پروتئین کبد غشایی سیتوکروم P۴۵۰ نیز با توجه به ویژگی‌های ساختاری آن‌ها مورد بحث قرار گرفت.
ترجمه شده با


پر ارجاع‌ترین مقالات مرتبط:

  • مقاله Biochemistry
  • ترجمه مقاله Biochemistry
  • مقاله بیوشیمی
  • ترجمه مقاله بیوشیمی
  • مقاله Molecular Biology
  • ترجمه مقاله Molecular Biology
  • مقاله زیست‌شناسی مولکولی
  • ترجمه مقاله زیست‌شناسی مولکولی
  • مقاله General Medicine
  • ترجمه مقاله General Medicine
  • مقاله طب عمومی
  • ترجمه مقاله طب عمومی
  • مقاله Structural Biology
  • ترجمه مقاله Structural Biology
  • مقاله زیست‌شناسی ساختاری
  • ترجمه مقاله زیست‌شناسی ساختاری
سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.