view in publisher's site

Flow charts for the systematic solid-state 19F/2H-NMR structure analysis of membrane-bound peptides

Solid-state NMR (SSNMR) is one of the most useful methods to investigate membrane-bound peptides and proteins, in order to elucidate the structural basis of their diverse biological functions. In the case of short peptides, SSNMR is now performed on a routine basis in several labs. By employing side-chain 19F- or 2H-isotope-labelled peptides in static oriented samples, SSNMR can provide information about conformation, alignment, dynamics, oligomerization, and aggregation behaviour. Changes in and transitions between these structural properties tend to be directly related to the functional mechanism of the peptides. Here, we present an easy-to-follow description of the methodological SSNMR approach in the form of flow charts. The successive steps needed, from peptide synthesis and functional tests, on to NMR sample preparation and NMR experiments, and further on to data analysis, are described. At each stage, questions to be answered and tasks to be performed are explained, and some representative results are illustrated. Relevant challenges and pitfalls are discussed, and possible reasons for problems and their possible solutions are considered.

نمودارهای جریان برای آنالیز ساختار حالت جامد سیستماتیک ۱۹ F / ۲ H - NMR پپتیدهای متصل به غشا

NMR حالت جامد (SSNMR)یکی از مفیدترین روش‌ها برای بررسی پپتیدها و پروتئین‌های متصل به غشا به منظور روشن ساختن اساس ساختاری عملکردهای بیولوژیکی متنوع آن‌ها است. در مورد پپتیدهای کوتاه، SSNMR در حال حاضر به صورت روتین در چندین آزمایشگاه انجام می‌شود. SSNMR با به کار گیری پپتیدهای لیبل شده با F - یا ۲ H زنجیره جانبی در نمونه‌های استاتیک گرا، می‌تواند اطلاعاتی در مورد ترکیب، همترازی، دینامیک، اولیگومریزاسیون و رفتار تجمع فراهم کند. تغییرات در و گذار بین این خواص ساختاری به طور مستقیم به مکانیزم عملکردی پپتیدها مربوط می‌شود. در اینجا، یک توصیف ساده از روش SSNMR در قالب نمودارهای جریان ارائه می‌دهیم. مراحل بعدی مورد نیاز، از سنتز پپتید و تست‌های عملکردی، تا آماده‌سازی نمونه NMR و آزمایش‌های NMR، و سپس تحلیل داده‌ها، توضیح داده می‌شوند. در هر مرحله، سوالاتی که باید پاسخ داده شوند و وظایفی که باید انجام شوند توضیح داده می‌شوند، و برخی نتایج نماینده نشان داده می‌شوند. چالش‌ها و دام‌های مرتبط مورد بحث قرار می‌گیرند، و دلایل احتمالی مشکلات و راه‌حل‌های احتمالی آن‌ها در نظر گرفته می‌شوند.
ترجمه شده با

Download PDF سفارش ترجمه این مقاله این مقاله را خودتان با کمک ترجمه کنید
سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

95/12/18 - با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس و کروم٬ چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.