view in publisher's site

Novel molecular markers for high-throughput sex characterization of Cynoglossus semilaevis

Highlights•An indel (insertion-deletion) -type variation was developed as marker.•Two SNP markers based on penta-primer amplification refractory mutation system.•The markers can ensure the high accuracy and high-throughput detection.•Provide an effective method for fish with sex chromosome genomic information.AbstractMale and female Chinese tongue soles (Cynoglossus semilaevis) exhibit a great difference in growth rates. Karyotype analysis has revealed that the species is heterogametic (ZW/ZZ), and sex-reversed “pseudo-males” exist under both natural and aquaculture conditions. In this study, we developed three female-specific molecular markers for the sex identification of C. semilaevis. The markers were an insertion-deletion (indel)-type structural variation and two single nucleotide polymorphism (SNP) loci on the ZW sex chromosome (SNP_chr_8936186_C_G and SNP_chr_8935925_C_T). The indel marker can be used for female-specific identification with traditional PCR and agarose gel electrophoresis. The detection and use of the SNPs are based on the penta-primer amplification refractory mutation system. The SNPs on the ZW chromosome were successfully identified with high-throughput quantitative PCR. The two types of molecular markers were successfully used to identify normal males and pseudo-males in a population of 60 C. semilaevis. When compared with currently used markers, the markers identified in this study have high accuracy and can help in high-throughput detection. Our findings could provide an effective method for detecting the gender of fish with the ZW karyotype.

markers مولکولی جدید برای تعیین جنسیت توان عملیاتی بالا از Cynoglossus semilaevis

کاره‌ای مهم (درج - حذف)- تنوع گونه‌ای به عنوان نشانگر توسعه داده شد. دو نشانگر SNP مبتنی بر سیستم جهش refractory amplification primer -. * می‌توانند دقت بالا و تشخیص بالا و خروجی را تضمین کنند. ارائه یک روش موثر برای ماهی با information.Abst sex genomic genomic ractMale و soles زبان چینی (Cynoglossus semilaevis)تفاوت زیادی در نرخ رشد نشان می‌دهد. آنالیز karyotype نشان داده‌است که گونه‌ها heterogametic (ZW / ZZ)هستند و "شبه نظامیان" وارونه " تحت شرایط طبیعی و آبی وجود دارند. در این مطالعه، ما سه مارکر مولکولی خاص برای شناسایی جنسیت C ایجاد کردیم. semilaevis. این نشانه‌ها عبارت بودند از درج - حذف (indel)- نوع پلی مورفیسم تک nucleotide تک nucleotide (SNP)بر روی کروموزوم جنسی ZW (SNP _ ۸۹۳۶۱۸۶ _ C و SNP _ chr _ C _ T). علامت indel می‌تواند برای شناسایی مخصوص زنان با الکتروفورز سنتی و الکتروفورز ژل agarose استفاده شود. تشخیص و استفاده از the براساس سیستم جهش refractory، پنتا - است. The روی کروموزوم ZW با موفقیت با توان عملیاتی بالا شناسایی شدند. دو نوع از مارکرهای مولکولی برای شناسایی مردان معمولی و شبه نظامیان در جمعیت ۶۰ درجه سانتی گراد به کار گرفته شدند. semilaevis. وقتی در مقایسه با مارکرهای استفاده‌شده در حال حاضر، مارکرهای شناسایی‌شده در این مطالعه دارای دقت بالایی هستند و می‌توانند به تشخیص بالا - خروجی کمک کنند. یافته‌های ما می‌تواند یک روش موثر برای تشخیص جنسیت ماهی با the karyotype فراهم کند.

ترجمه شده با

Download PDF سفارش ترجمه این مقاله این مقاله را خودتان با کمک ترجمه کنید
سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

95/12/18 - با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس و کروم٬ چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.