view in publisher's site

A multiplexed RT-LAMP assay for detection of group M HIV-1 in plasma or whole blood

Highlights•A multiplexed RT-LAMP assay for detection of group M HIV sequences was developed.•The conserved HIV RT-LAMP assay detects all isolates of major circulating subtypes.•Internal control primers were developed for application with whole blood.AbstractIsothermal nucleic acid amplification techniques, such as reverse-transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP), exhibit characteristics that are suitable for the development of a rapid, low-cost NAT that can be used at the POC. For demonstration of utility for global use, studies are needed to validate the performance of RT-LAMP for the detection of divergent subtypes. In this study, we designed and evaluated multiplexed HIV-1 integrase RT-LAMP primers to detect subtypes within group M, along with an RNase P positive internal processing and amplification control. Using a panel of 26 viral isolates representing the major circulating subtypes, we demonstrated detection of all isolates of subtypes A1, C, D, F1, F2, G, CRF01_AE, CRF02_AG, and two unique recombinant forms (URFs). A whole blood panel created with one representative isolate of each subtype was successfully amplified with the group M HIV-1 integrase and RNase P internal control primers. The group M HIV-1 RT-LAMP assay was further evaluated on 61 plasma specimens obtained from persons from Cameroon and Uganda. The sequence-conserved group M HIV-1 RT-LAMP primers, coupled to a low-cost amplification device, may improve diagnosis of acute infection at the POC and provide timely confirmation of HIV status.

یک سنجش منسجم RT - LAMP برای تشخیص گروه M - HIV - ۱ در پلاسما یا کل خون

نکات مهم: برای تشخیص گروه ام آی وی، یک سنجش (LAMP)(LAMP)(LAMP)(LAMP)ایجاد شد. * سنجش سنجش HIV - RT - LAMP، همه جدا شده از subtypes های گردش عمده را شناسایی می‌کند. * کنترل داخلی برای کاربرد با استفاده از تکنیک‌های تکثیر اسید نوکلییک اسید blood.Abst، مانند loop reverse loop - transcription - amplification (RT - LAMP)توسعه داده شدند، ویژگی‌هایی که برای توسعه یک NAT سریع و کم‌هزینه مناسب هستند که می‌توانند در the مورد استفاده قرار گیرند. برای نمایش کاربرد برای مصرف جهانی، مطالعات برای تایید عملکرد RT - LAMP برای تشخیص of های واگرا مورد نیاز است. در این مطالعه، ما اینتگراز HIV - ۱ RT - LAMP را برای کشف زیرمجموعه در گروه M، همراه با پردازش داخلی مثبت RNase H و کنترل تقویت، طراحی و ارزیابی کردیم. با استفاده از یک پانل ۲۶ ایزوله ویروسی که به نمایندگی از مجموعه زیرمجموعه اصلی گردش می‌کنند، ما تشخیص دادیم که تمام isolates های زیرمجموعه A۱، C، D، F۱، G، CRF۰۱ _ AG، CRF۰۲ _ AG، و دو فرم نوترکیب منحصربفرد (URFs). یک قسمت کامل خونی که با یک ایزوله نمایشی از هر نوع (subtype)ایجاد شد با گروه M - HIV - ۱ و primers کنترل داخلی RNase H با موفقیت تقویت شد. گروه M - ۱ RT - LAMP، در ۶۱ نمونه پلاسما که از افراد کامرون و اوگاندا بدست‌آمده بود، مورد ارزیابی قرار گرفت. گروه از گروه حفاظت‌شده M - HIV - ۱ RT - LAMP همراه با دستگاه تقویت کم‌هزینه، ممکن است تشخیص عفونت حاد را در the بهبود بخشد و تایید به موقع وضعیت HIV را فراهم کند.

ترجمه شده با

Download PDF سفارش ترجمه این مقاله این مقاله را خودتان با کمک ترجمه کنید
سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

95/12/18 - با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس و کروم٬ چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.