view in publisher's site

Chloroplast proteomics highlights the subcellular compartmentation of lipid metabolism

Recent advances in the proteomic field have allowed high throughput experiments to be conducted on chloroplast samples and the data are available in several databases such as the Plant Protein Database (PPDB), or the SubCellular Proteomic Database (SUBA). However, the accurate localization of many proteins that were identified in different subplastidial compartments often remains hypothetical, thus making quantitative proteomics important for going a step further into the knowledge of Arabidopsis thaliana chloroplast proteins with regard to their accurate localization within the chloroplast. Spectral counting, a semi-quantitative proteomic strategy based on accurate mass and time tags (AMT), was used to build up AT_CHLORO, a comprehensive chloroplast proteome database with curated subplastidial localization. In this review, we focus on about a hundred enzymes involved in fatty acid biosynthesis, export and metabolism (desaturation and oxylipin metabolism), in the synthesis of chloroplast-specific glycerolipids either with a eukaryotic or a prokaryotic structure. Two main chloroplast compartments play a major role in lipid biosynthesis: the initial steps of fatty acid biosynthesis take place in the stroma, then the envelope membranes concentrate most of the proteins involved in chloroplast glycerolipid metabolism.

metabolism proteomics chloroplast subcellular compartmentation of lipid lipid lipid highlights highlights highlights highlights highlights highlights of of of of of of of of of of of of of of of

پیشرفت‌های اخیر در زمینه proteomic اجازه می‌دهد تا آزمایش‌های عملیاتی بالایی بر روی نمونه‌های کلروپلاست انجام شود و داده‌ها در چندین پایگاه‌داده از جمله پایگاه‌داده پروتئین گیاهی (PPDB)، یا پایگاه‌داده subcellular proteomic (SUBA)موجود هستند. با این حال، مکان دقیق بسیاری از پروتیین‌ها که در بخش‌های مختلف subplastidial شناسایی شده‌اند اغلب فرضی هستند، در نتیجه proteomics کمی برای رفتن به آگاهی از پروتئین‌های کلروپلاستی Arabidopsis با توجه به موقعیت دقیق آن‌ها در داخل کلروپلاست بسیار مهم هستند. شمارش طیفی، یک استراتژی proteomic نیمه کمی مبتنی بر برچسب‌های دقیق و زمانی دقیق (AMT)برای ایجاد یک پایگاه‌داده proteome کلروپلاستی جامع با موقعیت subplastidial curated استفاده شد. در این بررسی، ما بر روی یک صد آنزیم درگیر در بیوسنتز اسیده‌ای چرب، صادرات و متابولیسم (desaturation و متابولیسم oxylipin)، در سنتز of ویژه کلروپلاست یا با یک ساختار پروکاریوتی و یا یک ساختار پروکاریوتی تمرکز می‌کنیم. دو بخش کلروپلاست اصلی نقش مهمی در بیوسنتز لیپید دارند: مراحل اولیه بیوسنتز اسیده‌ای چرب در استروما اتفاق می‌افتد، بعد غشای پوشش بیشتر پروتئین‌های دخیل در متابولیسم glycerolipid کلروپلاست را متمرکز می‌کند.
ترجمه شده با

سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.