view in publisher's site

Emerging Diversity in Lipid–Protein Interactions

High Resolution ImageDownload MS PowerPoint SlideMembrane lipids interact with proteins in a variety of ways, ranging from providing a stable membrane environment for proteins to being embedded in to detailed roles in complicated and well-regulated protein functions. Experimental and computational advances are converging in a rapidly expanding research area of lipid–protein interactions. Experimentally, the database of high-resolution membrane protein structures is growing, as are capabilities to identify the complex lipid composition of different membranes, to probe the challenging time and length scales of lipid–protein interactions, and to link lipid–protein interactions to protein function in a variety of proteins. Computationally, more accurate membrane models and more powerful computers now enable a detailed look at lipid–protein interactions and increasing overlap with experimental observations for validation and joint interpretation of simulation and experiment. Here we review papers that use computational approaches to study detailed lipid–protein interactions, together with brief experimental and physiological contexts, aiming at comprehensive coverage of simulation papers in the last five years. Overall, a complex picture of lipid–protein interactions emerges, through a range of mechanisms including modulation of the physical properties of the lipid environment, detailed chemical interactions between lipids and proteins, and key functional roles of very specific lipids binding to well-defined binding sites on proteins. Computationally, despite important limitations, molecular dynamics simulations with current computer power and theoretical models are now in an excellent position to answer detailed questions about lipid–protein interactions.

تنوع در تعاملات پروتیین - پروتیین

Resolution های SlideMembrane MS PowerPoint SlideMembrane با پروتیین‌ها به شیوه‌های مختلفی با پروتیین‌ها ارتباط برقرار می‌کنند، از فراهم کردن یک محیط غشا پایدار برای پروتیین‌ها، که در نقش‌های دقیق در عملکردهای پیچیده و منظم پروتیین قرار می‌گیرند. پیشرفت‌های تجربی و محاسباتی در یک حوزه تحقیقات گسترده در رابطه با برهمکنش‌های لیپید - پروتیین همگرا می‌شوند. Experimentally، پایگاه‌داده ساختار پروتیین غشای با رزولوشن بالا در حال رشد است، به طوری که توانایی شناسایی ترکیبات لیپیدی پیچیده غشاهای مختلف را برای بررسی زمان چالش زا و مقیاس‌های طولانی برهمکنش‌های لیپید - پروتیین و پیوند پروتیین‌ها با عملکرد پروتئین در انواعی از پروتئین‌ها بررسی می‌کند. Computationally، مدل‌های غشایی دقیق‌تر و کامپیوترهای قوی‌تر در حال حاضر می‌توانند نگاهی دقیق به برهم کنش پروتیین‌ها و افزایش همپوشانی با مشاهدات تجربی برای اعتبارسنجی و تفسیر مشترک شبیه‌سازی و آزمایش داشته باشند. در اینجا مقالاتی را بررسی می‌کنیم که از روش‌های محاسباتی برای مطالعه برهمکنش‌های detailed - پروتیین‌ها، همراه با زمینه‌های تجربی و فیزیولوژیکی کوتاه، با هدف پوشش جامع مقالات شبیه‌سازی در پنج سال گذشته استفاده می‌کنند. به طور کلی، یک تصویر پیچیده از تعاملات پروتیین‌ها، از طریق مجموعه‌ای از مکانیسم‌ها از جمله تعدیل خواص فیزیکی محیط چربی، تعاملات شیمیایی مفصل بین لیپیدها و پروتیین‌ها، و نقش‌های اصلی عملکردی چربی‌های بسیار خاص برای جایگاه‌های اتصال مشخص بر روی پروتیین‌ها، پدیدار می‌شود. Computationally، با وجود محدودیت‌های مهم، شبیه‌سازی‌های دینامیک مولکولی با توان کامپیوتر کنونی و مدل‌های نظری در حال حاضر در یک موقعیت عالی برای پاسخ دادن به پرسش‌های جزیی درباره تعاملات لیپید - پروتیین هستند.
ترجمه شده با


پر ارجاع‌ترین مقالات مرتبط:

  • مقاله General Chemistry
  • ترجمه مقاله General Chemistry
  • مقاله شیمی عمومی
  • ترجمه مقاله شیمی عمومی
سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

95/12/18 - با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس و کروم٬ چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.