view in publisher's site

Characterization of Lipid–Protein Interactions and Lipid-Mediated Modulation of Membrane Protein Function through Molecular Simulation

The cellular membrane constitutes one of the most fundamental compartments of a living cell, where key processes such as selective transport of material and exchange of information between the cell and its environment are mediated by proteins that are closely associated with the membrane. The heterogeneity of lipid composition of biological membranes and the effect of lipid molecules on the structure, dynamics, and function of membrane proteins are now widely recognized. Characterization of these functionally important lipid–protein interactions with experimental techniques is however still prohibitively challenging. Molecular dynamics (MD) simulations offer a powerful complementary approach with sufficient temporal and spatial resolutions to gain atomic-level structural information and energetics on lipid–protein interactions. In this review, we aim to provide a broad survey of MD simulations focusing on exploring lipid–protein interactions and characterizing lipid-modulated protein structure and dynamics that have been successful in providing novel insight into the mechanism of membrane protein function.

توصیف تعاملات پروتیین - پروتیین و مدولاسیون Lipid - Mediated عملکرد پروتئین Membrane از طریق شبیه‌سازی مولکولی

غشا سلولی یکی از اساسی‌ترین بخش‌های سلول زنده را تشکیل می‌دهد، که در آن فرایندهای کلیدی مانند انتقال انتخابی مواد و تبادل اطلاعات بین سلول و محیط آن توسط پروتئین‌های مرتبط با غشا وساطت می‌شود. ناهمگونی ترکیب چربی غشاهای زیستی و تاثیر مولکول‌های لیپید بر روی ساختار، دینامیک و عملکرد پروتئین‌های غشایی در حال حاضر به طور گسترده شناخته شده‌است. شناسایی این تعاملات از لحاظ عملکرد پروتئین - پروتئین مهم با روش‌های تجربی هنوز به طور بازدارنده‌ای چالش برانگیز است. شبیه‌سازی‌های دینامیک مولکولی (MD)یک روش مکمل قوی با resolutions زمانی و مکانی کافی برای بدست آوردن اطلاعات ساختاری سطح اتمی و energetics بر روی برهمکنش‌های پروتیین - پروتیین ارایه می‌دهند. هدف ما در این بررسی، ارایه یک بررسی گسترده از شبیه‌سازی‌های MD، با تمرکز بر بررسی برهمکنش‌های پروتیین - پروتیین و شناسایی ساختار و ساختار پروتیین مدوله شده لیپید و پویایی است که در ارایه بینش جدید به مکانیزم عملکرد پروتیین غشا موفق بوده‌اند.
ترجمه شده با


پر ارجاع‌ترین مقالات مرتبط:

  • مقاله General Chemistry
  • ترجمه مقاله General Chemistry
  • مقاله شیمی عمومی
  • ترجمه مقاله شیمی عمومی
سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

95/12/18 - با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس و کروم٬ چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.