view in publisher's site

In Silico Design of Novel Mutant Anti-MUC1 Aptamers for Targeted Cancer Therapy

The transmembrane glycoprotein mucin 1 (MUC1) is an attractive tumor marker for cancer therapy and diagnosis. The nine amino acid extracellular epitope APDTRPAPG of this protein is selectively recognized by the S2.2 single-stranded DNA anti-MUC1 aptamer, which has emerged as a promising template for designing novel targeting agents for MUC1-directed therapy. In this work, 100 ns molecular dynamics (MD) simulations, MM/GBSA binding free energy calculations, and conformational analysis were employed to propose a novel prospective anti-MUC1 aptamer with increased affinity toward the MUC1 epitope resulting from the double mutation of the T11 and T12 residues with PSU and U nucleosides, respectively. The double mutant aptamer exhibits a tight interaction with the MUC1 epitope and adopts a groove conformation that structurally favors the intermolecular contact with the epitope through the intermediate T11-A18 region leaving the 3′ and 5′ ends free for further chemical conjugation with a nanocarrier or pharmaceutical. These results are valuable to gain understanding about the molecular features governing aptamer-epitope interactions and constitute a first key step for the design of novel aptamer-based nanocarriers for MUC1-targeted cancer therapy.

در طراحی silico of Mutant Novel برای درمان هدفمند سرطان

The glycoprotein mucin ۱ (MUC۱)یک شاخص attractive برای درمان سرطان و تشخیص سرطان است. ۹ آمینو اسید - epitope اپی APDTRPAPG از این پروتئین به طور انتخابی توسط S۲ شناسایی شده‌است. ۲ DNA تک رشته‌ای DNA تک‌رشته‌ای، که به عنوان یک الگوی امیدوار کننده برای طراحی عامل‌های هدف قرار گرفته برای درمان MUC۱ - هدایت‌شده، پدیدار شده‌است. در این تحقیق، ۱۰۰ بررسی دینامیک مولکولی (MD)، MM / GBSA binding انرژی آزاد، و آنالیز conformational برای پیشنهاد یک روش جدید ضد - آپتامر با اتصال بالا به the MUC۱ به ترتیب از جهش دوگانه of و T۱۲ به ترتیب با PSU و U nucleosides به کار گرفته شد. دو جهش دوتایی، برهمکنش نزدیک با the اپی epitope را نشان می‌دهد و ترکیب شیار را اتخاذ می‌کند که از نظر ساختار پیوند بین مولکولی با the را از طریق ناحیه T۱۱ - A۱۸ که ۳ و ۵ ' را برای الحاق شیمیایی بیشتر با یک nanocarrier یا داروسازی آزاد می‌کند را می‌پذیرد. این نتایج برای کسب درک در مورد ویژگی‌های مولکولی حاکم بر برهمکنش‌های اپی - - epitope ارزشمند است و اولین گام کلیدی برای طراحی of مبتنی بر آپتامر بر پایه MUC۱ - هدفمند برای درمان سرطان هدفمند است.

ترجمه شده با

Download PDF سفارش ترجمه این مقاله این مقاله را خودتان با کمک ترجمه کنید
سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

95/12/18 - با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس و کروم٬ چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.