view in publisher's site

The Effect of RGD/NGR Peptide Modification of Melanoma Differentiation-Associated Gene-7/Interleukin-24 on Its Receptor Attachment, an In Silico Analysis

Melanoma differentiation-associated gene-7 (mda-7/interleukin [IL]-24), a unique tumor suppressor gene, induces selective apoptosis in tumor cells. Secreted IL-24 binds to heterodimeric receptor complexes of IL-20R1/IL-20R2, IL-22R1/IL-20R2, or sigma-1 receptor (Sig1R) that consequently enhances apoptosis. However, this mechanism is not well understood and most likely involves different pathways. Targeting of cytokine by tumor homing peptides (THPs) to the tumor cell surface molecule-like integrin shows to be beneficial in gene immunotherapy approaches. In this study, the in silico targeting of RGD/NGR-modified IL-24 to tumor cells was conducted. In this regard, the sequences of six new synthetic IL-24s that have been modified by RGD (Arg–Gly–Asp) or NGR (CRNGRGPDC) were aligned and their structures were modeled through homology modeling to evaluate their attachment potential to cognate receptor complexes such as IL-20R1/IL-20R2, IL-22R1/IL-20R2, or Sig1R. The results of homology modeling showed that modification of IL-24 with RGD motif in N-terminal and middle of this protein exhibited stronger interaction with cognate receptors. These results also demonstrated that modified IL-24 with RGD motif in the C-terminal has lost native activity. However, the interaction of THP-modified IL-24 with Sig1R would not be affected to that extent, interestingly. Conclusively, in silico analysis showed that modification of IL-24 with THPs needs a more detailed study as these modifications may disrupt native interaction with receptors and reduce apoptosis induction property. This structural analysis gives us a better understanding of mda-7/IL-24 interaction with cognate receptors and helps a more rational design for further cytokine modification.

اثر تغییر RGD / ngr بر اصلاح of - Associated - ۷ - Interleukin - ۲۴ در Receptor Receptor، a در تحلیل silico

ژن‌های مرتبط با تمایز Melanoma - ۷ (mda - ۷ / interleukin)، یک ژن مهار کننده تومور منحصر به فرد، باعث القای آپوپتوز انتخابی در سلول‌های توموری می‌شود. IL - ۲۴ با کمپلکس IL - ۲۰ R۱ / IL - ۲۰ R۱، IL - ۲۲ R۱، IL - ۲۰ R۱، و یا گیرنده سیگما - ۱ اتصال می‌یابد که در نتیجه باعث افزایش آپوپتوز می‌شود. با این حال، این مکانیسم به خوبی قابل‌درک نیست و به احتمال زیاد مسیرهای مختلفی را شامل می‌شود. هدف قرار دادن سیتوکین توسط پپتیدهای homing تومور (THPs)به سطح سلول توموری سطح سلول - مانند اینتگرین shows در روش‌های درمانی ژن‌درمانی بسیار سودمند است. در این مطالعه، the نرم‌افزاری با هدف قرار دادن IL - ۲۴ اصلاح‌شده IL - ۲۴ به سلول‌های سرطانی انجام شد. در این راستا، توالی شش IL - ۲۴ که توسط RGD (Arg - gly - آسپاراژین)یا ngr (CRNGRGPDC)اصلاح شده‌اند و ساختارهای آن‌ها از طریق مدل‌سازی همولوژی مدل‌سازی شده تا پتانسیل اتصال آن‌ها به کمپلکس‌های پروتئینی نظیر IL - ۲۰ R۱، IL - ۲۲ R۱، IL - ۲۰ R۲، یا Sig۱R را ارزیابی کند. نتایج مدلسازی همولوژی نشان داد که تغییر IL - ۲۴ با موتیف RGD در ترمینال N - ترمینال و میانی این پروتئین تعامل قوی‌تر با گیرنده‌های cognate نشان می‌دهد. این نتایج همچنین نشان داد که IL - ۲۴ اصلاح‌شده با موتیف RGD در پایانه C فعالیت بومی خود را از دست داده‌است. با این حال، تعامل IL - ۲۴ اصلاح‌شده با Sig۱R تا این حد تحت‌تاثیر قرار نمی‌گیرد، جالب است. Conclusively، در تحلیل silico نشان داد که اصلاح IL - ۲۴ با THPs نیاز به مطالعه دقیق‌تر دارد چرا که این تغییرات ممکن است تعامل شخص را با گیرنده‌های مختل کرده و خاصیت القای آپوپتوز را کاهش دهد. این تحلیل ساختاری درک بهتری از تعامل IL - ۷ / IL - ۲۴ با گیرنده‌های cognate می‌دهد و به طراحی منطقی‌تر برای تغییر بیشتر سیتوکین کمک می‌کند.
ترجمه شده با

سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

95/12/18 - با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس و کروم٬ چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.