view in publisher's site

Invited review: Advances and applications of random regression models: From quantitative genetics to genomics

ABSTRACTAn important goal in animal breeding is to improve longitudinal traits; that is, traits recorded multiple times during an individual's lifetime or physiological cycle. Longitudinal traits were first genetically evaluated based on accumulated phenotypic expression, phenotypic expression at specific time points, or repeatability models. Until now, the genetic evaluation of longitudinal traits has mainly focused on using random regression models (RRM). Random regression models enable fitting random genetic and environmental effects over time, which results in higher accuracy of estimated breeding values compared with other statistical approaches. In addition, RRM provide insights about temporal variation of biological processes and the physiological implications underlying the studied traits. Despite the fact that genomic information has substantially contributed to increase the rates of genetic progress for a variety of economically important traits in several livestock species, less attention has been given to longitudinal traits in recent years. However, including genomic information to evaluate longitudinal traits using RRM is a feasible alternative to yield more accurate selection and culling decisions, because selection of young animals may be based on the complete pattern of the production curve with higher accuracy compared with the use of traditional parent average (i.e., without genomic information). Moreover, RRM can be used to estimate SNP effects over time in genome-wide association studies. Thus, by analyzing marker associations over time, regions with higher effects at specific points in time are more likely to be identified. Despite the advances in applications of RRM in genetic evaluations, more research is needed to successfully combine RRM and genomic information. Future research should provide a better understanding of the temporal variation of biological processes and their physiological implications underlying the longitudinal traits.

مرور مورد دعوت: پیشرفت‌ها و کاربردهای مدل‌های رگرسیون تصادفی: از ژنتیک کمی تا ژنومیک

چکیده هدف مهم در پرورش و زاد و ولد حیوانات، بهبود ویژگی‌های طولی است؛ به این معنی که، صفات چندین بار در طول زندگی فردی و یا چرخه فیزیولوژیکی ثبت می‌شوند. صفات طولی ابتدا براساس بیان فنوتیپی تجمعی، بیان فنوتیپی در نقاط زمانی خاص، یا مدل‌های تکرارپذیری ارزیابی شدند. تاکنون، ارزیابی ژنتیکی صفات طولی عمدتا بر استفاده از مدل‌های رگرسیون تصادفی (RRM)متمرکز شده‌است. مدل‌های رگرسیون تصادفی امکان برازش اثرات ژنتیکی تصادفی و محیطی را در طول زمان فراهم می‌کنند که منجر به دقت بالاتر مقادیر اصلاحی برآورد شده در مقایسه با دیگر روش‌های آماری می‌شود. بعلاوه، RRM بینش‌هایی درباره تنوع موقتی فرایندهای بیولوژیکی و مفاهیم فیزیولوژیکی نهفته در ویژگی‌های مورد مطالعه ارائه می‌دهد. با وجود این واقعیت که اطلاعات ژنومی به طور قابل‌توجهی در افزایش نرخ پیشرفت ژنتیکی برای انواع ویژگی‌های مهم اقتصادی در چندین گونه دام نقش داشته‌است، در سال‌های اخیر توجه کمتری به صفات طولی شده‌است. با این حال، از جمله اطلاعات ژنومی برای ارزیابی صفات طولی با استفاده از RRM یک جایگزین عملی برای دستیابی به انتخاب دقیق‌تر و تصمیم‌گیری‌های حذف است، زیرا انتخاب حیوانات جوان ممکن است براساس الگوی کامل منحنی تولید با دقت بالاتر در مقایسه با استفاده از میانگین والدین سنتی (یعنی بدون اطلاعات ژنومی)باشد. علاوه بر این، می توان از RRM برای برآورد اثرات SNP در طول زمان در مطالعات ارتباط گسترده ژنوم استفاده کرد. بنابراین، با تجزیه و تحلیل ارتباطات نشانگر در طول زمان، نواحی با اثرات بالاتر در نقاط خاص در زمان به احتمال زیاد شناسایی می‌شوند. علی‌رغم پیشرفت‌ها در کاربردهای RRM در ارزیابی‌های ژنتیکی، برای ترکیب موفق RRM و اطلاعات ژنومیک به تحقیقات بیشتری نیاز است. تحقیقات آینده باید درک بهتری از تغییرات زمانی فرآیندهای بیولوژیکی و مفاهیم فیزیولوژیکی آن‌ها در زمینه ویژگی‌های طولی فراهم کنند.
ترجمه شده با


پر ارجاع‌ترین مقالات مرتبط:

  • مقاله Genetics
  • ترجمه مقاله Genetics
  • مقاله ژنتیک
  • ترجمه مقاله ژنتیک
  • مقاله Animal Science and Zoology
  • ترجمه مقاله Animal Science and Zoology
  • مقاله علوم حیوانات و جانورشناسی
  • ترجمه مقاله علوم حیوانات و جانورشناسی
  • مقاله Food Science
  • ترجمه مقاله Food Science
  • مقاله علوم غذایی
  • ترجمه مقاله علوم غذایی
سفارش ترجمه مقاله و کتاب - شروع کنید

95/12/18 - با استفاده از افزونه دانلود فایرفاکس و کروم٬ چکیده مقالات به صورت خودکار تشخیص داده شده و دکمه دانلود فری‌پیپر در صفحه چکیده نمایش داده می شود.